《跟踪孔令学》讲述了孔令学在课堂上没收了一个女孩的手机，导致了被她男朋友跟踪而产生的一系列故事。
主人公孔令学由范伟老师扮演，在东北的一所文武学校当语文老师。孔老师是一个典型的知识分子形象，有妻子有孩子，家庭虽然不富但是也美满和谐。一天，他在课堂上发现一名女学生在玩手机，极高的职业道德促使他没收了手机，他不知道的是女学生是学校舞蹈班，有很多爱慕者追求。
在众多追求者当中有一个不上学，在发廊学艺的小伙，叫阿祥。阿祥一副社会小混混打扮，得知心仪女神手机被没收，自然想借此表现一番，便夸下海口让老师交出手机，阿祥虽然是社会人的打扮，心里其实很忐忑。
于是他客客气气地找到了孔老师，想让他把手机还了。常教学生语文，气质十分儒雅的孔老师看到这幅社会人打扮，便嗤之以鼻，告诉阿祥学期结束就会还给女生手机。
阿祥眼见事情不成功，软磨硬泡也丝毫不见孔老师松口，于是开始了穷追不舍，天天跟踪孔老师。孔老师却哪他就去哪，一路跟一路跑，与老师寸步不离。
起初孔老师以为阿祥只是一时兴起，可随着一天天过去，阿祥“锲而不舍”地跟着，孔老师有些害怕了。
每当他质问阿祥：“你到底想干什么？”时候，还没等阿祥解释，便急匆匆的走掉，阿祥跟在后面小声的解释：“我就想帮您做点事，接接孩子，找我阿姨好好聊聊手机的事情”。而在孔老师眼里，他千百个不信任阿祥，笃定他是要打击报复自己。
被阿祥跟踪搞得手足无措的孔老师没有报警，而采取了社会上以暴制暴的方法，请体育老师介绍了当地的大混混为其解决此事。
社会大混混找了几个人把阿祥的理发店砸了，以示警告，外表是社会人打扮的阿祥实质内心很胆小脆弱，社会大哥一出手就把他震住了。阿祥满肚子委屈，他只是要孔老师还手机，为什么还教训自己？
事情得到圆满解决，孔老师满心欢喜将一直绷紧的神经松懈下来。虽然阿祥不再跟踪，但是让他意料不到的是一件又一件巧合的事情使他崩溃。
有天早上老师在门口发现了一副拐杖（实际是邻居大爷暂放），孔老师精神彻底崩溃，在极度的恐慌中把自己的妻子误认为作是阿祥，把妻子的腿砸伤了。最后校长把孔老师送去医院检查后发现得了焦虑症。电影最后孔老师病好，当他看到课堂上一个学生睡着了，没有叫醒他而是帮他盖好衣服。
《跟踪孔令学》是电影市场中少见的写实主义题材电影，题材小巧，但是剧本扎实，言之有物。影片从社会新闻角度入题，讲述一个卑微、认真，甚至有点偏执倔强的中学老师，如何正确处理与学生，与社会小青年关系的故事，揭示出社会中人与人之间由于沟通不畅而产生的隔阂，甚至酿成惨剧的现象。
尽管电影并没有非常炫技的花哨视听语言，但是利落干脆又别有深意的镜头剪切，把雪后的东北小城描绘得特别有人情味。而这种观众习以为常的人情味，又因为故事的一波三折，而产生出莫名其妙的荒谬感，把整个故事黑色幽默的风格烘托到极致。
影片在剧情片和纪录片之间完美混搭，成功地用最琐碎平常的日常生活小事，吸引住每一位观众的眼球。
