公元两百年间，三国鼎立，司马懿率大军攻打五丈原，诸葛亮所创的“八阵图”被寄予厚望。然而，北斗灯被误灭，诸葛亮去世，八阵图随之失传，六百年后，它将再度问世。传说“得八阵图者，得天下”。转眼间，唐朝末年，定军山的“玄武门”门主马云风为了防止战乱，封印了八阵图，但女魔头罂素闯入，打破了封印，八阵图复出。门主马云风临终前嘱咐徒弟荀日照，尽快找到八位将军的后人和八种兵器，以避免八阵图落入奸人之手。
荀日照武功平平，面对这艰巨的任务，他感到绝望。回到靖国将军府，他得知自己是诸葛武侯的后人，肩负着开启八阵图的重任。为了保护他，荀太君安排他与千家庄庄主千魁之女千寻成婚，千寻不仅武艺高强，而且美貌如花。然而，荀日照却抗拒包办婚姻，离家出走。在旅途中，他结识了身世可怜的蝶衣，两人相互照顾，产生了深厚的感情。
荀日照回到长安城后，发现了蝶衣与千寻的真相，原来他们是同母异父的姐妹。而蝶衣之父韩杰企图利用荀日照毁掉千寻全家。在此期间，荀日照结识了赏金猎人雪痕，两人结为好友，在对抗奸臣杨国忠的过程中，他们的关系进一步加深。雪痕发现了荀日照不同寻常的武学天赋，鼓励他修炼内功心法。
荀日照在密室中学习了《神鬼八阵图》的秘诀，武功大进。在一场生死劫难后，他决定迎娶千寻。然而，他不知道的是，蝶衣对他的感情已经超越了友情。雪痕，一直默默爱着千寻，却收到了七公主拾欢的热烈追求。此外，美艳牙婆桃花也痴心等待着蝶衣，而千家庄少庄主千冲则在等待蝶衣的归来。
罂素利用安禄山回京的机会，散布八阵图的消息，经过杨国忠的陷害，玄宗对靖国公府产生了怀疑，荀太君被赐死。荀日照从世袭靖国将军变成全国通缉的要犯。杨国忠、杨贵妃兄妹和安禄山在朝野间明争暗斗，最终各自打着保唐和灭唐的旗帜，各地战火纷飞。看着百姓流离失所，荀日照在千寻和雪痕的鼓励下重新振作起来，学成绝世武功，仿佛元神出窍，回到了六百年前，亲历先祖诸葛亮的壮志未酬的最后一战。他认清了自己的责任，找到了八位将军的后人，以各自的祖传兵器重起八阵图，帮助太子李亨号召天下勤王之师，平乱复唐，最终底定天下。
魔幻大剧《神鬼八阵图》。该剧制作班底是2005年火爆荧屏的神话剧《水月洞天》的原班人马，由蔡少芬、周海媚、于波、杨俊毅、陈法蓉等明星共同演绎。同时，该剧也是首部以《三国演义》中诸葛亮的“八阵图”为历史背景的超现实魔幻武侠巨献。
