孙爱军的行政级别为省部级副职或正厅级，目前担任的山东省发改委党组书记、主任一职明确为省部级副职。
孙爱军现任山东省发展和改革委员会党组书记、主任，同时是第十四届全国人大代表。根据我国行政体制，省级发改委作为省政府组成部门，其主任通常由副省长兼任或单独设置，行政级别为省部级副职。例如，山东省发改委主任若未由副省长兼任，则单独任职时仍按省部级副职配置，这与省级政府组成部门负责人的常规级别一致。
孙爱军曾担任共青团山东省委副书记（正厅级）、菏泽市委副书记（正厅级）、菏泽市市长（正厅级）、菏泽市委书记（正厅级）、聊城市委书记（正厅级）等职务。其中，市委书记、市长作为地级市党政一把手，行政级别为正厅级；共青团省委副书记虽为群团组织职务，但按惯例配置为正厅级。这些职务均属于厅局级正职范畴。
孙爱军的行政级别随职务调整逐步提升。从正厅级的共青团省委副书记、地市党政领导，到省发改委主任（省部级副职），体现了从厅局级到省部级的晋升路径。省发改委作为省级经济综合管理部门，其主任职务的重要性决定了高配为省部级副职的合理性，这也与孙爱军担任全国人大代表的政治身份相匹配。
我国《公务员法》规定，领导职务分为国家级正职至乡科级副职共十级。省部级副职包括各省（自治区、直辖市）党委常委、政府副职及省级政府组成部门主要负责人；正厅级对应地级市四大班子正职及省直部门副职。孙爱军当前职务明确属于省部级副职，过往职务则均为正厅级，符合行政级别晋升的常规逻辑。
