《慧眼识珠》故事核心围绕东林村女子柳慧珠的善良勇敢与最终收获幸福展开，展现了善有善报的主题。具体内容如下：
慧珠救蛇：东林村的柳慧珠容貌出众且心地善良，引得众多媒婆上门说亲。一日，她去给父亲送饭途中，看到几个小孩正在抽打一条浑身是伤却无伤人之意的花蛇。慧珠心生怜悯，连忙制止小孩，并分给他们馍吃，让他们回家，随后决定带花蛇回家为其治伤。经过半月照料，慧珠将花蛇放归自然。
勇救小翠：放归花蛇当日晌午，慧珠再次去给父亲送饭，路过杂树林时，发现草杈上挂着孙瘸子闺女小翠的绣鞋，地上痕迹显示小翠被人强行拖进树林。慧珠不顾危险，扔掉绣鞋后深入林中，看到一男子头套布袋正在撕扯小翠衣服。慧珠冷静应对，以自己替换小翠，让小翠趁机逃跑。然而，慧珠随后被男子扑倒，就在她绝望之时，樵夫李武听到呼救声赶来，行凶男子见状逃向密林深处。但村里人不相信慧珠未让恶人得逞，纷纷指责她是脏女人，慧珠父亲也埋怨她多管闲事，慧珠却表示不后悔救小翠，若再遇见仍会如此。
错嫁张文：不久后，有两家人不嫌弃慧珠前来求亲，分别是秀才张文和樵夫李武。慧珠对李武颇有好感，可父亲认为李武是樵夫，不如读书的秀才，坚持让慧珠嫁给张文。到了成亲之日，慧珠坐上张文的花轿，两家相隔三十里，慧珠在花轿里头晕脑胀，未注意到曾救下的花蛇慢慢爬进她的裙底。拜完堂后，慧珠在洞房等待，醉醺醺的张文推门而入，欲强行与慧珠发生关系。此时，慧珠发现张文胸口上的黑痣与之前行凶的变态男子一模一样，于是提膝一脚将张文踹到床下，指责他。张文却如饿狼般再次扑来，还脱下裤子，就在这时，花蛇突然出现咬住张文下身。张文强忍疼痛拔出匕首斩下蛇头，但蛇毒攻心，张家公婆赶来时，张文已毒发身亡。喜事变丧事，张家公婆将怒火怪罪到慧珠身上，称她不干净且克夫，没过几天就将慧珠送回了娘家。慧珠父亲为女儿的婚事操碎了心，担心女儿成了寡妇更没人要。
终嫁李武：话音刚落，樵夫李武提着两只野鸡前来向慧珠提亲。慧珠父亲喜上眉梢，慧珠却问李武是否嫌弃自己脏和克夫。李武憨厚地表示，自己不在乎那些，只觉得慧珠心眼好，是个好女人，还称母亲告诉他看人要看心，娶妻要娶贤。不久后，李武将慧珠娶进家门，圆房当晚，李武惊讶地发现慧珠竟还是大姑娘，慧珠笑道是李武“慧眼识珠”。
主题升华：慧珠人美心善，为救她人勇敢牺牲自己，虽名誉受损但从不后悔。最终，坏人得到惩罚，慧珠也收获了幸福，印证了“善有善报，恶有恶报，不是不报，时候未到”的道理。
