朱元璋阻挠灭日的原因有：战略考虑、文化差异、外交手段、避免战争消耗、个人信仰。
1、战略考虑：朱元璋认为，日本地理位置遥远，攻打日本需要耗费大量的人力、物力和财力，而且可能会引发其他国家的反感和干涉。因此，他认为应该先稳定国内局势，发展经济，提高国力，再考虑对外扩张。
2、文化差异：朱元璋对日本的文化和风俗并不了解，他担心攻打日本会引起文化冲突，导致战争无法顺利进行。
3、外交手段：朱元璋认为，通过外交手段可以更好地解决与日本的矛盾和冲突。他希望通过和平谈判，达到维护国家利益的目的。
4、避免战争消耗：朱元璋深知战争的残酷性，他不希望因为攻打日本而导致无辜百姓的生命财产受到损失。
5、个人信仰：朱元璋信奉佛教，佛教主张慈悲为怀，不杀生。因此，从个人信仰的角度来看，他也不愿意发动战争。
朱元璋的政治举措
明初官僚机构沿袭自元朝。朱元璋进行了改革，在中央废除中书省，明初中书省负责天下政务，其长官为左、右丞相，位高权重，丞相极易与皇帝发生矛盾，明朝时以胡惟庸任丞相后最甚。胡惟庸势力逐大，威胁皇权，且日益骄横，懈怠政事。于是，洪武十三年（1380年），朱元璋以图谋不轨之名处死了胡惟庸和有关的官员，同时宣布废除中书省，不再设丞相。
在地方废除行省制，设立承宣布政使司、都指挥使司和提刑按察使司，分别担负行中书省的职责，三者分立又互相牵制，防止了地方权力过重。在各府县的重要地方，朱元璋还设置了巡检司，负责把关盘查、缉捕盗贼、盘诘奸伪。
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