唯一明确柯南（工藤新一）主动向小兰透露真实身份的集数为动画第555集《鸢尾花的秘密》。以下为相关情节的详细梳理：
在《鸢尾花的秘密》中，柯南因案件调查陷入危机，为保护小兰的安全并避免其因身份隐瞒持续陷入危险，最终选择主动向小兰坦白自己因服用APTX4869药物缩小、化名“江户川柯南”的真相。这一情节是动画中唯一明确由柯南主动承认身份的场景，标志着两人关系的关键转折点。
第7集“每月一件礼物恐吓事件”小兰通过柯南的推理能力、对新一习惯的了解（如足球知识）等细节产生怀疑，并直接询问“你是不是新一”。柯南虽险些暴露，但通过阿笠博士用变声器伪装新一的声音，以“新一委托自己保护小兰”为由暂时隐瞒身份。此集仅为小兰的试探，柯南未主动承认。
第203-208集“危命的复活”系列小兰通过血型（柯南与新一均为A型）、行为习惯（如用右手写字）等细节进一步确认柯南身份，甚至直接质问“你就是新一吧”。柯南虽未否认，但通过制造“新一与柯南同时出现”的假象（如让灰原哀伪装成自己），再次隐瞒真相。此系列中柯南仍选择隐瞒，未主动坦白。
动画中柯南（新一）主动向小兰透露身份的情节仅出现在第555集，其他集数或为小兰的试探、柯南的被动暴露风险，或通过其他手段隐瞒身份。这一设定既符合主线剧情中“保护小兰”的核心逻辑，也通过唯一性强化了第555集的戏剧张力与情感冲击。
