宝应县卫生局的主要职责包括以下几点：
建立和实施全县基本药物制度：指导和监督全县医疗机构的基本药物采购、配送和使用，确保药品供应的安全、有效和可及性。
指导公立医院改革：推动公立医院的体制机制改革，提高医疗服务质量和效率，保障公立医院的公益性质。
推进公共卫生服务均等化：制定和实施公共卫生服务政策，确保全县居民能够享受到均等的公共卫生服务。
卫生事业发展规划与年度计划实施：全面负责卫生事业的发展规划制定和实施，以及年度计划的执行，推动卫生事业的持续发展。
农村卫生、社区卫生、妇幼卫生工作：制定和实施相关工作规划，提高农村、社区和妇幼卫生服务水平。
疾病预防控制与公共卫生事件应对：负责疾病预防控制工作，以及公共卫生事件的监测预警、风险评估和应急处置。
食品安全监管：参与食品安全监管工作，确保食品安全。
健康教育与健康促进：开展健康教育和健康促进活动，提高全县居民的健康意识和健康水平。
医疗机构全行业监督管理：对全县医疗机构进行全行业监督管理，确保医疗服务的规范和质量。
中医药事业发展规划与实施：制定和实施中医药事业发展规划，推动中医药事业的发展。
卫生应急工作：负责卫生应急工作的组织、协调和实施，提高全县应对突发公共卫生事件的能力。
医学科技发展与科研成果应用：推动医学科技的发展和科研成果的应用，提高全县医疗技术水平。
卫生人才队伍建设与继续医学教育：负责卫生人才队伍建设，以及继续医学教育工作，提高全县卫生人才的专业素质。
卫生事业经费管理：负责卫生事业经费的预算、决算和财务审计，确保经费的合理使用。
此外，宝应县卫生局还负责爱国卫生运动委员会、县政府血地寄防领导小组和县艾滋病防治工作委员会的日常工作，以及政府交办的其他卫生相关事项。
