初判深圳疫情为境外输入关联疫情，是指经基因测序和流行病学调查，发现深圳新增无症状感染者与境外输入的英国变异毒株高度同源，且感染链条与境外货轮作业相关，因此判定此次疫情由境外输入病例或物品引发本地传播。 具体分析如下：
基因测序显示病毒为英国变异株深圳市疾控中心对前五例无症状感染者进行基因组序列测定，结果显示其新冠病毒序列高度同源（同源性达99.99%），且均属于在英国出现的变异毒株。这一结果证明前五例感染者属于同一感染来源或传播链，且病毒源自境外。
综合判定为境外输入关联疫情尽管另两例个案的基因测序仍在进行中，但结合前五例的测序结果、流行病学调查（病例均与盐田港区境外货轮作业相关），可初步认定此次疫情由境外输入病例或物品引发，并通过本地接触传播形成关联病例。因此，判定为“境外输入关联疫情”。
总结：深圳通过基因测序锁定病毒为英国变异株，并通过流调确认感染链条与境外货轮作业相关，最终判定此次疫情为境外输入病例或物品引发本地传播的关联疫情。这一结论为后续防控措施（如加强港口作业人员管理、扩大核酸检测范围）提供了科学依据。
